深海病毒科
深海病毒科（學名：Abyssoviridae）是網巢病毒目的一個科，為具包膜的正單鏈RNA病毒，本科為一單型分類單元，僅包含甲型深海病毒屬（Alphaabyssovirus）一個屬，該屬亦為單型，僅有海兔深海病毒一型（Aplysia abyssovirus 1，AAbV）一種[1]，為感染加州海兔的病毒，由美國國家生物技術資訊中心（NCBI）公開的轉錄組霰彈槍序列組裝(transcriptome shotgun assembly) 與表現序列標籤資料庫中經BLAST比對發現，於2018年發表[2]。
深海病毒科
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病毒分類 
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| （未分级）： | 病毒 Virus |
| 域： | 核糖病毒域 Riboviria |
| 界： | 正核糖病毒界 Orthornavirae |
| 门： | 小核糖病毒门 Pisuviricota |
| 纲： | 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes |
| 目： | 套式病毒目 Nidovirales |
| 科： | 深海病毒科 Abyssoviridae |
| 属： | 甲型深海病毒屬 Alphaabyssovirus |
| 亞屬與種 | |
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命名
深海病毒科的學名得名自英文的"abyss"（意指「深淵」），除了指本科病毒感染的宿主海兔生存於海洋外，還指傳說中居於地下深處的蘇美神祇阿勃祖，亦指此病毒為透過深度定序技術自序列資料庫中發現[2]。
病毒學
海兔深海病毒一型的基因組長35,913nt，為已知RNA病毒中基因組大小次大者，僅次於同屬網巢病毒目之渦蟲分泌細胞網巢病毒（PSCNV）的41,103nt[2][3]。AAbV的基因組包含兩個開放閱讀框（ORF），一為典型網巢病毒的ORF1a與ORF1b融合而成，一為其3'端編碼結構蛋白的開放閱讀框ORF2，另外還有長74nt的5'UTR與長964nt的3'UTR[2]。
相較於其他網巢病毒的ORF1a與ORF1b間有一促進-1核糖體移碼的序列，AAbV的ORF1中與ORF1a和ORF1b同源的區域間有一同框的終止密碼子UGA與一促進轉譯連讀的序列，使部分核糖體轉譯至此時發生連讀而繼續轉譯ORF1b的序列，以此調控ORF1b編碼蛋白的表現[2]。
參考文獻
- ^ Virus Taxonomy: 2018 Release. International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). October 2018 [26 January 2019]. （原始内容存档于4 March 2018）.
- ^ 2.0 2.1 2.2 2.3 2.4 Bukhari, Khulud; Mulley, Geraldine; Gulyaeva, Anastasia A.; Zhao, Lanying; Shu, Guocheng; Jiang, Jianping; Neuman, Benjamin W. Description and initial characterization of metatranscriptomic nidovirus-like genomes from the proposed new family Abyssoviridae, and from a sister group to the Coronavirinae, the proposed genus Alphaletovirus.. Virology. 2018, 524: 160–171. ISSN 0042-6822. OCLC 7856217008. PMC 7112036
. PMID 30199753. doi:10.1016/j.virol.2018.08.010 （英语）.
- ^ Saberi, Amir; Gulyaeva, Anastasia A.; Brubacher, John L.; Newmark, Phillip A.; Gorbalenya, Alexander E. A planarian nidovirus expands the limits of RNA genome size. PLOS Pathogens. 2018-11-01, 14 (11): e1007314. PMC 6211748 . PMID 30383829. doi:10.1371/journal.ppat.1007314.
