马来西亚武装部队总司令是马来西亚武装部队的专业领袖。总司令是马来西亚武装部队中普通人能到達的最高级别,仅次于最高統帥马来西亚最高元首 。
截至2024年,共有22人被任命为国防军总司令,其中两名来自马来西亚皇家空军,一名来自马来西亚皇家海军。