黃配玄（？—1645年），字承文，号位兩，江西撫州府樂安縣（今江西省樂安縣）人，明朝政治人物，同進士出身。
萬曆四十三年（1615年）乙卯科舉人，崇禎七年（1634年），登甲戌科進士[1]，吏部观政，十月授南直隶望江县知县，八年调任懷寧縣知縣[2]。此後升任南京兵科給事中[2]。崇禎十四年（1641年），任安廬巡撫[3]。丁内艱去。
