同源框

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同源(异形)框(英語:Homeobox),或稱「同源匣」是某些影響動物真菌植物發育的基因所擁有的一段DNA序列,擁有同源框的基因稱作同源异形基因,統稱同源异形基因家族。

Homeodomain
The Antennapedia homeodomain protein from Drosophila melanogaster bound to a fragment of DNA.[1] The recognition helix and unstructured N-terminus are bound in the major and minor grooves respectively.
鑑定
標誌同源框结构域(Homeodomain)
PfamPF00046旧版
Pfam宗系CL0123旧版
InterPro英语InterProIPR001356
SMART英语Simple Modular Architecture Research ToolSM00389
PROSITE英语PROSITEPDOC00027
SCOP英语Structural Classification of Proteins1ahd / SUPFAM

這段序列之長度約180個核苷酸,能轉錄出一段蛋白質结构域,稱為同源框结构域(Homeodomain)。

概述

同源框長約180個碱基对,編碼可與DNA結合的蛋白質位點(同源域)。同源框基因編碼的轉錄因子通常會開啟一系列其他基因,例如形成腿所需的所有基因。同源框结构域特異性結合DNA。然而,單一同源域蛋白的特異性通常不足以僅識別其所需的目標基因。在大多數情況下,同源性域蛋白在其目標基因的啟動子區域中發揮作用,通常與其他轉錄因子和同源性域蛋白形成複合物。此類複合物比單一同源域蛋白具有更高程度的標靶特異性[2][3]

參見

參考文獻

  1. ^ PDB 1AHD; Billeter M, Qian YQ, Otting G, Müller M, Gehring W, Wüthrich K. Determination of the nuclear magnetic resonance solution structure of an Antennapedia homeodomain-DNA complex. Journal of Molecular Biology. Dec 1993, 234 (4): 1084–93. PMID 7903398. doi:10.1006/jmbi.1993.1661. 
  2. ^ Gehring, W. J. The homeobox in perspective. Trends in Biochemical Sciences. August 1992, 17 (8): 277–280. ISSN 0968-0004. PMID 1357790. 
  3. ^ Bürglin, Thomas R.; Affolter, Markus. Homeodomain proteins: an update. Chromosoma. 06 2016, 125 (3): 497–521. ISSN 1432-0886. PMC 4901127 . PMID 26464018. doi:10.1007/s00412-015-0543-8.