Let-7
let-7是最早发现的两种microRNA之一(第一种是lin-4),2000年由加里·鲁夫昆等人发现于模式生物秀麗隱桿線蟲的基因组中[1],之后通过BLAST在果蝇和人类基因组中发现了同源物[2],形成了let-7非编码RNA家族。人类miR-98 microRNA前体是let-7家族成员。目前已在多种物种中预测或通过实验证实Let-7 miRNA(MIPF0000002[3])。miRNA最初转录为长转录本(长达数百个核苷酸),称为初级miRNA(pri-miRNA),在细胞核中由Drosha和Pasha加工成约70个核苷酸的发夹结构。这些前体(前miRNA, pre-miRNA)通过exportin5输出到细胞质中,随后在Dicer酶的作用下加工成约22个核苷酸的成熟miRNA。Dicer参与miRNA加工表明其与RNA干扰现象存在关联。
let-7 microRNA precursor | |
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预测的let-7二级结构和保守序列 | |
识别符 | |
代号 | let-7 |
Rfam | RF00027 |
miRBase | MI0000001 |
miRBase | MIPF0000002 |
其他数据 | |
RNA类型 | Gene; miRNA |
域 | Eukaryota |
基因組位置
在人類基因組中,簇let-7a-1/let-7f-1/let-7d位於9q22.3的B區域內,具有定義標記D9S280-D9S1809。 D11S1345-D11S1316位點之間的一個最小LOH(杂合性丢失)區域包含miR-125b1/let-7a-2/miR-100簇。 miR-99a/let-7c/miR-125b-2 簇位於HD的21p11.1 區(純合缺失)。簇let-7g/miR-135-1位於區域3的3p21.1-p21.2處。[4]
let-7家族
let-7基因最早在线虫中被发现,是一种关键的发育调节因子,并成为已知的第两种 microRNA 之一(另一种是lin-4)。[1] 很快,"let-7"在果蝇中也被发现,并通过BLAST(基本局部比对搜索工具)研究被确认为第一个已知的人类 miRNA。[2] let-7 家族成员的成熟形式在物种间高度保守。
表達調控
尽管在未分化细胞中检测不到成熟的let-7成员的水平,但是let-7的初级转录本和发夹结构前体存在于这些细胞中。[5] 这表明成熟的let-7 miRNA可能以转录后方式受到调控。
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Let-7的目標
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可能用於癌症的臨床治療
鑒於在線蟲中,let-7 功能喪失會導致細胞過度擴散和未分化的突出表型,以及其靶點在細胞命運決定上的作用,let-7 與人類癌症密切相關,並作為一種腫瘤抑制因子。
診斷
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治療
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人类同源物
参考文献
- ^ 1.0 1.1 Reinhart B.J.; et al. The 21-nucleotide let-7 RNA regulates developmental timing in Caenorhabditis elegans. Nature. 2000, 403 (6772): 901–906. Bibcode:2000Natur.403..901R. PMID 10706289. S2CID 4384503. doi:10.1038/35002607.
- ^ 2.0 2.1 Pasquinelli A.E.; et al. Conservation of the sequence and temporal expression of let-7 heterochronic regulatory RNA. Nature. 2000, 408 (6808): 86–89. Bibcode:2000Natur.408...86P. PMID 11081512. S2CID 4401732. doi:10.1038/35040556.
- ^ MIPF0000002
- ^ Calin GA, Sevignani C, Dumitru CD, Hyslop T, Noch E, Yendamuri S, et al. Human microRNA genes are frequently located at fragile sites and genomic regions involved in cancers. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. March 2004, 101 (9): 2999–3004. Bibcode:2004PNAS..101.2999C. PMC 365734 . PMID 14973191. doi:10.1073/pnas.0307323101 .
- ^ Thomson JM, Newman M, Parker JS, Morin-Kensicki EM, Wright T, Hammond SM. Extensive post-transcriptional regulation of microRNAs and its implications for cancer. Genes & Development. August 2006, 20 (16): 2202–2207. PMC 1553203 . PMID 16882971. doi:10.1101/gad.1444406.