敦煌護軍，十六國時期官名。
北涼神璽二年（398年），在敦煌郡境內設置敦煌護軍，治敦煌（今甘肅省敦煌市西南），屬沙州。段業時有敦煌護軍郭謙[1]。天璽二年（400年），西涼奪得敦煌護軍。李玄盛以宋繇為右將軍，領敦煌護軍[1]。玄始十年（421年），敦煌護軍被北涼佔領。北魏滅北涼，廢除敦煌護軍。
