DNA片段化

DNA片段化是將DNA鏈分離或打斷成碎片。它可以由實驗室人員或細胞有意完成,也可以在生物體內自發地發生。自發或意外的DNA斷裂是在細胞中逐漸積累的斷裂。DNA片段化是許多DNA有關實驗的開始步驟.

DNA片段化的主要度量指標是DNA碎片指數(DFI)。[1]有報道認為大於或等於20%的DFI會顯着降低ICSI後的成功率。[1]

實驗中的片段化方法

通常在構建DNA序列或亞克隆文庫等實驗前需要進行DNA片段化。有多種物理方法用於打碎DNA,如:超聲處理、needle shear、霧化、流體剪切。[2]使用酶打碎DNA的方法有內切酶處理和轉座酶處理法[3]

用途

DNA片段化在法醫學,尤其是在DNA分析中發揮着重要作用。

  1. ^ 1.0 1.1 Speyer BE, Pizzey AR, Ranieri M, Joshi R, Delhanty JD, Serhal P. Fall in implantation rates following ICSI with sperm with high DNA fragmentation. Hum Reprod. May 2010, 25 (7): 1609–1618. PMID 20495207. doi:10.1093/humrep/deq116 . 
  2. ^ Quail, Michael Andrew. DNA: Mechanical Breakage. 2010. ISBN 978-0470016176. doi:10.1002/9780470015902.a0005333.pub2. 
  3. ^ Syed, Fraz; Grunenwald, Haiying; Caruccio, Nicholas. Next-generation sequencing library preparation: simultaneous fragmentation and tagging using in vitro transposition. Nature Methods. 2009-11, 6 (11) [2023-11-01]. ISSN 1548-7105. doi:10.1038/nmeth.f.272. (原始內容存檔於2023-11-01) (英語).