刘启元，字仁甫，江西抚州府金溪县北市人。明朝政治人物。同进士出身。
万历七年（1579年）己卯科举人，万历十七年（1589年）登己丑科进士，授浙江台州府推官，台故濒海，时有小寇聚众，伪称倭寇，每鼓浪猝至，男女奔窜，惟所掳掠。启元条议六策，悉中机宜，奸宄遂绝。有烈妇冤死，累官不决，启元廉得主名，擒其凶，立毙之，民为立刘公庙。又去石滩之险者，以便舟行，今称刘公滩。升刑部主事，以艰归，遂不复仕，年九十卒[1]。
著有《易学余韵》、《丘钤篇》、《浅说篇》、《凿石篇》。
