隼冠状病毒HKU27
隼冠状病毒HKU27(Falcon coronavirus UAE-HKU27,FalCoV UAE-HKU27)是丁型冠状病毒属的一种病毒,在阿拉伯联合大公国杜拜的隼粪便样本中发现,于2018年由香港大学研究团队发表。此病毒与同时发表的翎颌鸨冠状病毒HKU28(HouCoV UAE-HKU28)和鸽冠状病毒HKU29(PiCoV UAE-HKU29)复制酶保守区的胺基酸序列相似度大于90%,应属同一物种的不同亚种[1]。
隼冠状病毒HKU27 | |
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病毒分类 | |
(未分级): | 病毒 Virus |
域: | 核糖病毒域 Riboviria |
界: | 正核糖病毒界 Orthornavirae |
门: | 小核糖病毒门 Pisuviricota |
纲: | 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes |
目: | 套式病毒目 Nidovirales |
科: | 冠状病毒科 Coronaviridae |
属: | 丁型冠状病毒属 Deltacoronavirus |
亚属: | 鹎丁型冠状病毒亚属 Buldecovirus |
种: | 隼冠状病毒HKU27 Falcon coronavirus UAE-HKU27
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基因组
隼冠状病毒HKU27的基因组约长26200nt,编码冠状病毒皆有的复制酶(1ab)以及刺突蛋白(S)、外膜蛋白(E)、膜蛋白(M)与衣壳蛋白(N)等四种结构蛋白,另有6、7a、7b、7c与7d等五个开放阅读框编码辅助蛋白,其基因顺序为1ab-S-E-M-6-N-7a-7b-7c-7d,其中7a位于衣壳蛋白的开放阅读框内,7b、7c与7d则位于其下游(即基因组的最3端)[1]。
演化
隼冠状病毒HKU27与翎颌鸨冠状病毒HKU28、鸽冠状病毒HKU29属于同一物种,其中翎颌鸨与鸽为隼的猎物,且阿拉伯人有训练隼协助捕猎翎颌鸨的习惯,病毒可能因这种掠食者-猎物的关系而在这些鸟类中传播。丁型冠状病毒属中,三种病毒组成的物种和绣眼冠状病毒HKU16(WeCoV HKU16)的关系较为接近,但其刺突蛋白的序列与鹊鸲冠状病毒HKU18(MRCoV HKU18)的较为接近,可能是此区域序列发生重组的结果。另外血清测试结果显示杜拜当地有相当高比例的隼具有抗隼冠状病毒HKU27的抗体[1]。
参考文献
- ^ 1.0 1.1 1.2 Lau, Susanna K. P.; Wong, Emily Y. M.; Tsang, Chi-Ching; Ahmed, Syed Shakeel; Au-Yeung, Rex K. H.; Yuen, Kwok-Yung; Wernery, Ulrich; Woo, Patrick C. Y.; Gallagher, Tom. Discovery and Sequence Analysis of Four Deltacoronaviruses from Birds in the Middle East Reveal Interspecies Jumping with Recombination as a Potential Mechanism for Avian-to-Avian and Avian-to-Mammalian Transmission. Journal of Virology. 2018, 92 (15). ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.00265-18.