SNOMED CT
SNOMED CT(Systematized Nomenclature of Medicine -- Clinical Terms,醫學系統命名法-臨床術語,醫學術語系統命名法-臨床術語),是一部經過系統組織編排的,便於計算機處理的醫學術語集,涵蓋大多數方面的臨床信息,如疾病、所見、操作、微生物、藥物等。採用該術語集,可以協調一致地在不同的學科、專業和照護地點之間實現對於臨床數據的標引、存儲、檢索和聚合。同時,它還有助於組織病歷內容,減少臨床照護和科學研究工作中數據採集、編碼及使用方式的變異。
目的
在指稱同一事物的時候,不同的臨床醫生和醫療衛生機構往往會採用不同的臨床術語。例如,對於心臟病學專科醫師來說,心臟病發作、心肌梗死以及MI可能指的是同一含義,而對於電腦來說,三者之間則全然不同。因此,不同的醫療保健服務提供者、醫療服務設施、研究人員以及其他相關方之間需要協調一致地交換臨床信息(語義互操作性);而且,不同的地方對於醫學信息的記錄方式也各不相同(如採用紙質記錄或者採用電子記錄),因而需要一種廣泛全面而又協調統一的醫學術語系統(medical terminology system),作為信息基礎結構(information infrastructure)的組成部分。
設計
SNOMED CT是一個組配式概念體系(compositional concept system,組合式概念體系)。這就是說,可以通過與其他概念的組合,對概念加以特化。SNOMED CT是以描述邏輯為基礎,在設計上便於將內容作為一種動態資源加以維護。
組成要素
- 概念:每個唯一性數字型代碼、唯一性名稱(全稱,即Fully Specified Name)和描述(包括一條首選術語和一條或多條同義詞)所指定的基本含義單位。
- 描述:賦予同一概念的不同術語或名稱(同義詞)。
- 層級結構:19 個高級層級結構;每個高層層級結構又分別具有各自的子級層級結構。
- 關係:用於在同一層級結構之內或不同層級結構之間將不同的概念聯繫起來。
- 子集[1]
基本設計原理
284196006|Burn of skin|: {246112005|Severity|=24484000|severe, 363698007|Finding Site|= 113185004|Structure of skin between fourth and fifth toes|:272741003|Laterality|=7771000|left|}
與SNOMED CT特定發布版本之中所已經收錄的那套實體相比,此類表達式屬於是所謂的'後組配型'(post-coordinated,後組型),而前者通常從總體上稱為'先組配型'(pre-coordinated,先組型)概念。不過,這些先組配型概念之中的大多數(85%)當前實際上還屬於是原初型實體(primitive entities)。
注意:在其他的上下文(語境)或項目之中,'coordination'一詞可能並不是指對某個候選新建表達式的詳細說明,而可能是指在多重層級結構之中集成某一概念的後續操作(也就是對此概念加以分類)。然而,在SNOMED CT術語集之中,當說到已經對某一表達式進行了'後組配'的時候,並不意味着同時也對其進行了分類。
在同時顧及到SNOMED CT發布版本數據集之中已經收錄的那些概念以及最終用戶群體所已經創建或有待創建的任何其他特別概念的情況下,對於任何此類後組配型表達式的可靠分析和比較,的確都相當需要運用某種合適的描述邏輯分類算法。截至2007年,SNOMED CT的內容將其本身局限於EL++形式體系的一種子集;SNOMED CT將自身局限於下列運算符:
top, bottom primitive roles and concepts with asserted parent(s) for each concept definition and conjunction but NOT disjunction or negation role hierarchy but not role composition domain and range constraints existential but not universal restriction a restricted form of role inclusion axiom (xRy ^ ySz => xRz)
在不久的將來,可能會對其邏輯加以擴展,從而將一般概念蘊含公理(General Concept Inclusion Axioms)包括進來。
理論上而言,為了評估其究竟是早已在世界範圍內分發的那370,000個先組配型概念之中的任何一個已有概念的父概念、先祖概念、子概念或者其他後裔概念,還是在語義上與之等價,可以將描述邏輯推理應用於任何新的候選後組配型表達式。不過,部分隨着與CTV3之間合併產物的不斷沉降,2007年SNOMED的內容之中依然含有未被發現的語義重複性原初型概念和定義型概念。此外,許多概念依然歸屬原初型,但同時它們的語義卻又可以利用同時存在於該系統之中的其他原初型概念和作用關係(roles)加以合理合法的定義。正是因為語義內容之中的這些疏漏之處以及實際或可能存在的冗餘,各種用來推導歸類關係或語義等價關係的算法在實際當中的性能必將不夠完善,但程度卻無法預知。
特性
採用同一部諸如SNOMED CT之類的標準術語集來記錄信息的好處,與採用電子照護記錄以及採用結構化形式記錄臨床信息的那些好處息息相關。
用途
SNOMED CT是美國聯邦政府指定的一套數據標準之一,旨在用於臨床信息的電子交換。
採用SNOMED CT的計算機應用程序示例
歷史
2002年1月,SNOMED RT(SNOMED Reference Terminology,醫學術語系統命名法-參考術語集)與英國國家衛生服務部(National Health Service,NHS)的臨床術語(Clinical Terms,又稱為Read Codes)相互合併,並經過擴充和結構重組,從而形成了SNOMED CT[2]。SNOMED RT在歷史上的優點就是它的那些專業醫學術語集以及所採用的分布式協作開發方法,而第3版臨床術語(Clinical Terms Version 3,CTV3)的優勢則是它在全科醫學方面的那些術語集[3]。通過把這兩個體系組合起來,SNOMED CT目前成為現有任何語言之中最為廣泛全面的臨床詞表,收錄有超過344,000個概念,涵蓋了臨床醫學的大多數方面[2]。SNOMED CT還與其他的術語集之間進行着交叉映射,如ICD-9-CM、ICD-O3、ICD-10、實驗室方面的LOINC以及OPCS-4。SNOMED CT還支持ANSI(頁面存檔備份,存於網際網路檔案館),DICOM(頁面存檔備份,存於網際網路檔案館),HL7,and ISO(頁面存檔備份,存於網際網路檔案館)標準[4]。2002年4月,發布了SNOMED CT 西班牙語版;2003年4月,發布了SNOMED CT 德語版。
美國國立醫學圖書館(National Library of Medicine,NLM)代表美國健康與人類服務部(Department of Health and Human Services, HHS),就核心SNOMED CT(包括西班牙語版和英文版)及其不斷更新的永久許可證,與美國病理學家協會(College of American Pathologists,CAP)之間簽署了一份協議。這份合同旨在為NLM提供一份永久性的許可證(頁面存檔備份,存於網際網路檔案館),以便在NLM的一體化醫學語言系統[5]UMLS Metathesaurus之中分發SNOMED,在美國國內供美國政府(聯邦、州、地方和屬地)和私營組織機構免費使用。這份合同同時還涵蓋了美國病理學家協會在2003年6月30日至2008年6月29日之間所發行的對於SNOMED CT的更新。
2007年4月,國際衛生術語標準制定組織(International Health Terminology Standards Development Organization,IHTSDO)收購了SNOMED CT。
參考文獻
參見
- 國際衛生術語標準制定組織(International Health Terminology Standards Development Organization,IHTSDO)
- HL7
- CPT
- ICD-O
- UMLS
- LOINC
- MEDCIN
- 臨床數據交換標準協會(Clinical Data Interchange Standards Consortium,CDISC)
- DOCLE
外部連結
- IHTSDO 網站 - SNOMED 所有者主頁(頁面存檔備份,存於網際網路檔案館)
- www.snomed.org(正在搬遷)(頁面存檔備份,存於網際網路檔案館)
- CAP SNOMED Terminology Solutions - SNOMED CT的原創者(頁面存檔備份,存於網際網路檔案館)
- CliniClue SNOMED CT Browser - 免費軟件下載
- UMLS-SNOMED 常見問題解答(頁面存檔備份,存於網際網路檔案館)
- NHS Connecting for Health UK
- SNOB - Desktop SNOMED Browser - 免費軟件下載
- SNOMED CT Browser with SNOFLAKE view at dataline.co.uk
- VMIL 術語瀏覽器
- SNOCat: SNOMED Categorizer/Browser