段騎督（?—?），西晉到五胡十六國時代軍事人物，遼西鮮卑族，段部鮮卑首領段末波的弟弟。
318年，段末波殺堂叔段涉復辰，成為段部鮮卑的首領。任用弟弟段騎督、段牙。段涉復辰的侄子段匹磾從幽州攻打令支的段末波，段末波擊敗段匹磾。段匹磾在幽州殺害晉朝太尉劉琨，劉琨將佐投降後趙石勒。段末波派弟弟段騎督進攻段匹磾，段匹磾、段文鴦率眾準備投奔邵續。
