东北刺猬冠状病毒HKU31
东北刺猬冠状病毒HKU31(Erinaceus amurensis hedgehog coronavirus HKU31、Ea-HedCoV HKU31)是乙型冠状病毒属的一种病毒,在中国的东北刺猬肠道样本中发现,于2019年由香港大学的研究团队发表。此病毒与感染西欧刺猬的刺猬冠状病毒关系接近,核苷酸序列相似度为79.6%,与中东呼吸症候群冠状病毒(MERS-CoV)的核苷酸序列相似度则为68.4%,这些病毒与扁颅蝠冠状病毒HKU4与伏翼蝠冠状病毒HKU5皆属乙型冠状病毒属的Marbevirus亚属[1]。
东北刺猬冠状病毒HKU31 | |
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病毒分类 | |
(未分级): | 病毒 Virus |
域: | 核糖病毒域 Riboviria |
界: | 正核糖病毒界 Orthornavirae |
门: | 小核糖病毒门 Pisuviricota |
纲: | 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes |
目: | 套式病毒目 Nidovirales |
科: | 冠状病毒科 Coronaviridae |
属: | 乙型冠状病毒属 Betacoronavirus |
种: | 东北刺猬冠状病毒HKU31 Erinaceus amurensis hedgehog coronavirus HKU31
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基因组
东北刺猬冠状病毒HKU31的基因组约长30000nt,编码冠状病毒皆有的复制酶(1a/1b)和刺突蛋白(S)、膜蛋白(M)、外膜蛋白(E)与衣壳蛋白(N)等四种结构蛋白,另有3a、3b、4a、4b、5与8b等六个开放阅读框编码辅助蛋白,基因顺序为1ab-S-3a-3b-4a-4b-5-E-M-N-8b,其中8b位于衣壳蛋白的开放阅读框之内[1]。
刺突蛋白的氨基酸序列分析与结构模拟显示此病毒应不是使用二肽基肽酶-4(DPP4)为感染细胞的受体[1]。
参考文献
- ^ 1.0 1.1 1.2 Lau, Susanna K. P.; Luk, Hayes K. H.; Wong, Antonio C. P.; Fan, Rachel Y. Y.; Lam, Carol S. F.; Li, Kenneth S. M.; Ahmed, Syed Shakeel; Chow, Franklin W.N.; Cai, Jian-Piao; Zhu, Xun; Chan, Jasper F. W.; Lau, Terrence C. K.; Cao, Kaiyuan; Li, Mengfeng; Woo, Patrick C. Y.; Yuen, Kwok-Yung. Identification of a Novel Betacoronavirus (Merbecovirus) in Amur Hedgehogs from China. Viruses. 2019, 11 (11): 980. ISSN 1999-4915. doi:10.3390/v11110980.