薛祖學(?—1556年1月23日),陕西西安府渭南縣人,民籍。明朝政治人物。
正德八年(1513年)癸酉科陕西乡试舉人,九年(1514年)联捷甲戌科三甲第三十名進士[1][2],初授四川内江县知县,擢升兵部主事,历郎中,以事贬和州同知,官至泗州知州[3]。嘉靖三十四年(1556年)臘月十二日子时(23:00~24:00),因在地震时落入一丈多深的水穴被淹死。