鹌鹑冠状病毒HKU30
鹌鹑冠状病毒HKU30(Quail coronavirus UAE-HKU30,QuaCoV UAE-HKU30)是丁型冠状病毒属的一种病毒,在阿拉伯联合酋长国迪拜的鹌鹑粪便样本中发现,于2018年由香港大学研究团队发表。此病毒与猪丁型冠状病毒(PdCV)和麻雀冠状病毒HKU17(SpCoV HKU17)的复制酶保守区域的氨基酸序列相似度高于90%,显示三种病毒应为同一物种的不同亚种[1]。
鹌鹑冠状病毒HKU30 | |
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病毒分类 | |
(未分级): | 病毒 Virus |
域: | 核糖病毒域 Riboviria |
界: | 正核糖病毒界 Orthornavirae |
门: | 小核糖病毒门 Pisuviricota |
纲: | 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes |
目: | 套式病毒目 Nidovirales |
科: | 冠状病毒科 Coronaviridae |
属: | 丁型冠状病毒属 Deltacoronavirus |
亚属: | 鹎丁型冠状病毒亚属 Buldecovirus |
种: | 鹌鹑冠状病毒HKU30 Quail coronavirus UAE-HKU30
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基因组
鹌鹑冠状病毒HKU30的基因组约长25900nt,编码冠状病毒皆有的复制酶(1ab)以及刺突蛋白(S)、外膜蛋白(E)、膜蛋白(M)与衣壳蛋白(N)等四种结构蛋白,另有6、7a、7b与7c等四个开放阅读框编码辅助蛋白,其基因顺序为1ab-S-E-M-6-N-7a-7b-7c,其中7a位于衣壳蛋白的开放阅读框内,7b与7c则位于其下游(即基因组的最3端)[1]。
此病毒虽与猪丁型冠状病毒和麻雀冠状病毒HKU17关系密切,但其刺突蛋白的序列与文鸟冠状病毒HKU13(MuCoV HKU13)的较为接近,可能是前述两病毒与后者发生重组的产物[1]。
参考文献
- ^ 1.0 1.1 1.2 Lau, Susanna K. P.; Wong, Emily Y. M.; Tsang, Chi-Ching; Ahmed, Syed Shakeel; Au-Yeung, Rex K. H.; Yuen, Kwok-Yung; Wernery, Ulrich; Woo, Patrick C. Y.; Gallagher, Tom. Discovery and Sequence Analysis of Four Deltacoronaviruses from Birds in the Middle East Reveal Interspecies Jumping with Recombination as a Potential Mechanism for Avian-to-Avian and Avian-to-Mammalian Transmission. Journal of Virology. 2018, 92 (15). ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.00265-18.