鵪鶉冠狀病毒HKU30
鵪鶉冠狀病毒HKU30(Quail coronavirus UAE-HKU30,QuaCoV UAE-HKU30)是丁型冠狀病毒屬的一種病毒,在阿拉伯聯合大公國杜拜的鵪鶉糞便樣本中發現,於2018年由香港大學研究團隊發表。此病毒與豬丁型冠狀病毒(PdCV)和麻雀冠狀病毒HKU17(SpCoV HKU17)的複製酶保守區域的胺基酸序列相似度高於90%,顯示三種病毒應為同一物種的不同亞種[1]。
鵪鶉冠狀病毒HKU30 | |
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病毒分類 | |
(未分級): | 病毒 Virus |
域: | 核糖病毒域 Riboviria |
界: | 正核糖病毒界 Orthornavirae |
門: | 小核糖病毒門 Pisuviricota |
綱: | 小南嵌套病毒綱 Pisoniviricetes |
目: | 套式病毒目 Nidovirales |
科: | 冠狀病毒科 Coronaviridae |
屬: | 丁型冠狀病毒屬 Deltacoronavirus |
亞屬: | 鵯丁型冠狀病毒亞屬 Buldecovirus |
種: | 鵪鶉冠狀病毒HKU30 Quail coronavirus UAE-HKU30
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基因組
鵪鶉冠狀病毒HKU30的基因組約長25900nt,編碼冠狀病毒皆有的複製酶(1ab)以及刺突蛋白(S)、外膜蛋白(E)、膜蛋白(M)與衣殼蛋白(N)等四種結構蛋白,另有6、7a、7b與7c等四個開放閱讀框編碼輔助蛋白,其基因順序為1ab-S-E-M-6-N-7a-7b-7c,其中7a位於衣殼蛋白的開放閱讀框內,7b與7c則位於其下游(即基因組的最3端)[1]。
此病毒雖與豬丁型冠狀病毒和麻雀冠狀病毒HKU17關係密切,但其刺突蛋白的序列與文鳥冠狀病毒HKU13(MuCoV HKU13)的較為接近,可能是前述兩病毒與後者發生重組的產物[1]。
參考文獻
- ^ 1.0 1.1 1.2 Lau, Susanna K. P.; Wong, Emily Y. M.; Tsang, Chi-Ching; Ahmed, Syed Shakeel; Au-Yeung, Rex K. H.; Yuen, Kwok-Yung; Wernery, Ulrich; Woo, Patrick C. Y.; Gallagher, Tom. Discovery and Sequence Analysis of Four Deltacoronaviruses from Birds in the Middle East Reveal Interspecies Jumping with Recombination as a Potential Mechanism for Avian-to-Avian and Avian-to-Mammalian Transmission. Journal of Virology. 2018, 92 (15). ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.00265-18.