祁連郡,中國前涼時設置的郡。
前涼後期,分張掖郡置祁連郡,領漢陽、祁連三縣,治所為漢陽,屬涼州。前涼滅亡後,祁連郡相繼為前秦(376年-386年)、後涼(386年-398年)、北涼(398年-439年)所有。北涼玄始元年(412年),祁連郡改屬秦州。承和七年(439年),祁連郡降於北魏,郡廢。