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自然主义通常是指继承唯物主义和实用主义衣钵、不探究自然界中超自然因素的哲学立场，其理论基础认为所有现象皆可用自然理由的概念解释。自然主义不一定认为超自然现象和假设不存在或就是荒谬，但是所有的现象和假设必须可以用相同的方法来研究，因此任何超自然事物或是不存在，或是不可知，或是与自然现象和假设没有本质区别。
任何限制于自然、物理、唯物方法和解释范围内的探索和调查手段，或者积累知识的过程，都可归入自然主义。
许多科学哲学家用“方法自然主义”（又译“方法论自然主义”，“自然方法论”）和“科学自然主义”来指科学方法中被长久广为遵循的常规，即使用方法论假设可观察的自然现象只能由自然原因来解释，而不假设超自然能力是否存在，因此也不接受超自然的解释。与“存在论自然主义”或“形而上学自然主义”相对，这些思想认为：自然界（包括整个宇宙）就是存在的全部，因此超自然事物是不存在的。
这是由支持科学和演化论的哲学家提出，他们在“创造论对演化论的争议”中反对创造论或智能设计论，把“方法论自然主义”称为“科学唯物主义”或者“方法论唯物主义”，与“形而上学自然主义”结合，进一步支持他们提出的“现代科学是无神论”的理念。与其相对的自然哲学手段则接受对自然现象的超自然解释，从而被称为“有神论科学”或伪科学。
无神论（英语：Atheism），在广义上，是指一种不相信神存在的观念；在狭义上，无神论是指对相信任何神存在的一种抵制。无神论与通常至少相信一种神存在的有神论形成一个对比。
无神论一词源起于古希腊语ἄθεος，最初指的是对较广为接受的宗教所持有的否定态度，但随着自由思想和科学怀疑论的传播，以及对宗教的批评的增多，这一词语的对象范围也逐渐狭窄起来。第一个自称为“无神论者”的人出现在18世纪。法国大革命是历史上的第一次与无神论有关的大型政治运动，其倡导人们理性至上。 无神论者不相信神的常见理据包括没有经验证据支持；罪恶问题、启示不一致论证、神的不可证伪性及无信仰论证。此外也有许多从哲学、社会学、历史学等角度出发的不同的无神论论证。尽管很多无神论者的思想都倾向各种世俗哲学（例如人文主义、理性主义和自然主义），但无神论者之间并没有一个共同的思想体系。许多无神论者认为，无神论是一种较有神论简约的世界观，因此，驳斥上帝存在的举证责任不在无神论者身上。但是，从有神论者的立场来看，这是有神存在的理由。
由于无神论的概念有所不同，而且在许多地区，自称无神论者往往会受到其他宗教信徒的排挤、 歧视甚至攻击，因此无神论人口难以估计。若干探讨相关问题的全球综合调查是由盖洛普国际进行：他们2015年中访问超过64,000人的调查指出，11％的人是“坚定的无神论者”，而较早的2012年调查发现，13％受访者是“坚定的无神论者”。由英国广播公司于2004年进行的一个调查显示，无神论者为全世界人口的8％。其他较旧的估计显示，无神论者占世界人口的2％，而无宗教信仰的则进一步占12％,在发达国家中,较能允许自由开放与批判性思想, 所以通常无神论者比例也较高。
根据最近很多研究显示：教育程度和智力测验越高的受试者中，无神论者的比例比一般人高，尤其是从事科学方面的研究者占最高比例。