生態系統多樣性（英語：Ecosystem diversity），可指一個地區的生態系統層次上的多樣性，或一個生物圈中的各種生態系統。此詞語和生物多樣性不同，生物多樣性是指是生物或物種變化的程度，不一定是指生態系統。
以下是一些具有多樣性的生態系統：
