司馬文深(4世纪—401年),东晋宗室,司马承的玄孙,司馬無忌的曾孙,司馬恬之孙,司馬恢之的儿子。
高阳王司馬毅在永嘉之乱时被杀。直到东晋末年,隆安元年(397年),晋安帝以谯敬王司马恬次子司马恢之子司马文深出继司马毅,袭封高阳王(治所在今河北省蠡县南十五里)。在位五年,隆安五年(401年)去世,无嗣,再以高密王司馬純之之子、司馬文深的族侄司馬法蓮出继司马文深,袭封高阳王。