CccDNA
cccDNA即共价闭合环状DNA (covalently closed circular DNA)是一种有三级结构的双链环状DNA分子,最早是在噬菌体中发现的,而在自然界中被DNA病毒(如多瘤病毒科)感染的其它细胞中也有发现。[1][2]
产生
cccDNA在一些病毒侵染宿主细胞核时产生并在随后永久的存在于核内,其前体是一种线型的双链DNA,通过DNA连接酶作用闭环而形成cccDNA。大部分情况下这些病毒的DNA只有在这样的状态下才能进行转录。cccDNA通常被认为是游离的DNA或是“微小基因组” (minigenome),但质粒不一定是cccDNA。
存在形式
cccDNA的存在形式在逆转录病毒(或者说单链RNA逆转录病毒,如正反转录病毒亚科)和拟逆转录病毒(即双链DNA逆转录病毒)的侵染过程中是相同的。然而前者DNA立刻整合到宿主基因组中,后者则是游离在核质中。
实例
cccDNA是花椰菜病毒科和肝病毒科(包括乙肝病毒 HBV)的典型特征。其中乙肝病毒(HBV)的cccDNA的前体是与蛋白质外壳相连的“松弛环状DNA”(rcDNA 或 relaxed circular DNA),其本质是含有可配对的黏性末端的线型DNA(因碱基互补配对而成环状)。[3] 被乙肝病毒感染之后,通过治疗可以使cccDNA不易被活化,因此cccDNA的活性是乙肝的治疗中的一个指标。[4]
结构
- 参见 DNA超螺旋
参见
資料來源
- ^ Mosevitskaia, T.V., E.B. Pavel'chuk, and N.V. Tomilin. Substrate of a UV-induced repair system providing for W-reactivation of lambda phage. Genetika. 1976, 12 (8): 131–138. PMID 1001892.
- ^ Kunisada, T. and H. Yamagishi. Sequence repetition and genomic distribution of small polydisperse circular DNA purified from HeLa cells. Gene. November 1984, 31 (1–3): 213–223. PMID 6098526. doi:10.1016/0378-1119(84)90212-9.
- ^ Guo H., D. Jiang, T. Zhou, A. Cuconati, T.M. Block, and J.T. Guo. Characterization of the intracellular deproteinized relaxed circular DNA of hepatitis B virus: an intermediate of covalently closed circular DNA formation. J Virol. November 2007, 81 (22): 12472–12484. PMC 2169032 . PMID 17804499. doi:10.1128/JVI.01123-07.
- ^ Bourne, E.J.; Dienstag, J.L.; Lopez, V.A.; et al. Quantitative analysis of HBV cccDNA from clinical specimens: correlation with clinical and virological response during antiviral therapy. Journal of Viral Hepatitis. January 2007, 14 (1): 56–63. doi:10.1111/j.1365-2893.2006.00775.x.