DNA片段化

DNA片段化是将DNA链分离或打断成碎片。它可以由实验室人员或细胞有意完成,也可以在生物体内自发地发生。自发或意外的DNA断裂是在细胞中逐渐积累的断裂。DNA片段化是许多DNA有关实验的开始步骤.

DNA片段化的主要度量指标是DNA碎片指数(DFI)。[1]有报道认为大于或等于20%的DFI会显着降低ICSI后的成功率。[1]

实验中的片段化方法

通常在构建DNA序列或亚克隆文库等实验前需要进行DNA片段化。有多种物理方法用于打碎DNA,如:超声处理、needle shear、雾化、流体剪切。[2]使用酶打碎DNA的方法有内切酶处理和转座酶处理法[3]

用途

DNA片段化在法医学,尤其是在DNA分析中发挥着重要作用。

  1. ^ 1.0 1.1 Speyer BE, Pizzey AR, Ranieri M, Joshi R, Delhanty JD, Serhal P. Fall in implantation rates following ICSI with sperm with high DNA fragmentation. Hum Reprod. May 2010, 25 (7): 1609–1618. PMID 20495207. doi:10.1093/humrep/deq116 . 
  2. ^ Quail, Michael Andrew. DNA: Mechanical Breakage. 2010. ISBN 978-0470016176. doi:10.1002/9780470015902.a0005333.pub2. 
  3. ^ Syed, Fraz; Grunenwald, Haiying; Caruccio, Nicholas. Next-generation sequencing library preparation: simultaneous fragmentation and tagging using in vitro transposition. Nature Methods. 2009-11, 6 (11) [2023-11-01]. ISSN 1548-7105. doi:10.1038/nmeth.f.272. (原始内容存档于2023-11-01) (英语).